Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD34P28906 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD34P28906 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD34P28906 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD34P28906 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD34P28906 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD34P28906 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD34P28906 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD34P28906 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD34P28906 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD34P28906 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD34P28906 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD34P28906 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD34P28906 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD34P28906 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD34P28906 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD34P28906 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD34P28906 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD34P28906 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD34P28906 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD34P28906 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD34P28906 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD34P28906 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD34P28906 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD34P28906 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD34P28906 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD34P28906 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD34P28906 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD34P28906 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD34P28906 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD34P28906 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD34P28906 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD34P28906 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD34P28906 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD34P28906 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD34P28906 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD34P28906 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD34P28906 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD34P28906 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD34P28906 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD34P28906 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD34P28906 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD34P28906 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD34P28906 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD34P28906 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD34P28906 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD34P28906 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD34P28906 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD34P28906 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CD34P28906 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD34P28906 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD34P28906 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD34P28906 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD34P28906 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD34P28906 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD34P28906 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD34P28906 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD34P28906 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD34P28906 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD34P28906 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD34P28906 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD34P28906 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD34P28906 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD34P28906 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD34P28906 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD34P28906 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD34P28906 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD34P28906 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD34P28906 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD34P28906 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD34P28906 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD34P28906 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD34P28906 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD34P28906 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD34P28906 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD34P28906 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD34P28906 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD34P28906 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD34P28906 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD34P28906 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD34P28906 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD34P28906 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD34P28906 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD34P28906 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD34P28906 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD34P28906 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD34P28906 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD34P28906 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD34P28906 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD34P28906 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD34P28906 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD34P28906 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD34P28906 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD34P28906 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD34P28906 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD34P28906 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD34P28906 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD34P28906 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD34P28906 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD34P28906 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms