Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
DNMT1P26358 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
DNMT1P26358 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
DNMT1P26358 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
DNMT1P26358 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
DNMT1P26358 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
DNMT1P26358 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
DNMT1P26358 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
DNMT1P26358 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
DNMT1P26358 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
DNMT1P26358 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
DNMT1P26358 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
DNMT1P26358 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
DNMT1P26358 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.89
DNMT1P26358 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
DNMT1P26358 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
DNMT1P26358 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
DNMT1P26358 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
DNMT1P26358 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
DNMT1P26358 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
DNMT1P26358 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
DNMT1P26358 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
DNMT1P26358 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
DNMT1P26358 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
DNMT1P26358 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
DNMT1P26358 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
DNMT1P26358 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
DNMT1P26358 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
DNMT1P26358 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
DNMT1P26358 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms