Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.6 ms