Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF1BP20333 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF1BP20333 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF1BP20333 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms