Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLUP10909 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLUP10909 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLUP10909 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLUP10909 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLUP10909 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLUP10909 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLUP10909 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLUP10909 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLUP10909 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLUP10909 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLUP10909 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLUP10909 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLUP10909 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLUP10909 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLUP10909 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLUP10909 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLUP10909 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLUP10909 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLUP10909 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLUP10909 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLUP10909 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLUP10909 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLUP10909 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLUP10909 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLUP10909 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLUP10909 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLUP10909 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLUP10909 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLUP10909 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLUP10909 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLUP10909 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLUP10909 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLUP10909 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLUP10909 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLUP10909 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLUP10909 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLUP10909 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLUP10909 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLUP10909 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLUP10909 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLUP10909 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLUP10909 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLUP10909 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLUP10909 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLUP10909 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLUP10909 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLUP10909 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLUP10909 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLUP10909 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLUP10909 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLUP10909 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLUP10909 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLUP10909 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLUP10909 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLUP10909 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLUP10909 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLUP10909 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLUP10909 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLUP10909 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLUP10909 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLUP10909 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLUP10909 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLUP10909 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLUP10909 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLUP10909 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLUP10909 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLUP10909 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLUP10909 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLUP10909 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLUP10909 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLUP10909 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLUP10909 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLUP10909 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLUP10909 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLUP10909 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLUP10909 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLUP10909 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLUP10909 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLUP10909 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLUP10909 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLUP10909 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLUP10909 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLUP10909 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLUP10909 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLUP10909 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLUP10909 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLUP10909 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLUP10909 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLUP10909 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLUP10909 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLUP10909 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLUP10909 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLUP10909 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLUP10909 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLUP10909 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLUP10909 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLUP10909 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLUP10909 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLUP10909 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms