Protein–RNA interactions for Protein: P08294

SOD3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3P08294 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOD3P08294 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOD3P08294 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOD3P08294 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOD3P08294 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOD3P08294 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOD3P08294 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOD3P08294 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOD3P08294 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD3P08294 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD3P08294 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD3P08294 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD3P08294 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD3P08294 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD3P08294 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD3P08294 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD3P08294 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD3P08294 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD3P08294 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD3P08294 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD3P08294 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD3P08294 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD3P08294 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD3P08294 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD3P08294 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD3P08294 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD3P08294 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD3P08294 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD3P08294 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD3P08294 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD3P08294 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOD3P08294 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOD3P08294 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOD3P08294 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOD3P08294 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOD3P08294 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOD3P08294 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOD3P08294 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOD3P08294 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOD3P08294 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOD3P08294 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOD3P08294 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOD3P08294 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOD3P08294 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOD3P08294 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOD3P08294 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOD3P08294 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOD3P08294 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOD3P08294 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOD3P08294 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOD3P08294 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOD3P08294 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOD3P08294 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOD3P08294 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOD3P08294 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOD3P08294 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOD3P08294 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOD3P08294 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOD3P08294 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOD3P08294 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOD3P08294 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOD3P08294 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOD3P08294 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOD3P08294 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOD3P08294 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOD3P08294 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOD3P08294 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOD3P08294 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOD3P08294 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOD3P08294 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOD3P08294 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOD3P08294 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOD3P08294 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOD3P08294 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOD3P08294 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOD3P08294 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD3P08294 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD3P08294 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD3P08294 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD3P08294 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD3P08294 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD3P08294 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD3P08294 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD3P08294 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD3P08294 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD3P08294 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD3P08294 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD3P08294 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD3P08294 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms