Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHEP01854 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHEP01854 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGHEP01854 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGHEP01854 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGHEP01854 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHEP01854 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHEP01854 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHEP01854 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHEP01854 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHEP01854 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHEP01854 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHEP01854 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHEP01854 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHEP01854 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHEP01854 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGHEP01854 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IGHEP01854 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGHEP01854 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGHEP01854 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHEP01854 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHEP01854 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHEP01854 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHEP01854 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHEP01854 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHEP01854 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHEP01854 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHEP01854 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHEP01854 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHEP01854 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHEP01854 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHEP01854 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHEP01854 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHEP01854 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHEP01854 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHEP01854 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHEP01854 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHEP01854 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHEP01854 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHEP01854 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHEP01854 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHEP01854 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGHEP01854 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGHEP01854 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHEP01854 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHEP01854 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHEP01854 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHEP01854 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHEP01854 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHEP01854 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHEP01854 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHEP01854 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHEP01854 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHEP01854 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHEP01854 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHEP01854 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHEP01854 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHEP01854 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHEP01854 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHEP01854 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHEP01854 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHEP01854 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHEP01854 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHEP01854 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHEP01854 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHEP01854 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHEP01854 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHEP01854 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHEP01854 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGHEP01854 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHEP01854 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHEP01854 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHEP01854 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHEP01854 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHEP01854 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHEP01854 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGHEP01854 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGHEP01854 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGHEP01854 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGHEP01854 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGHEP01854 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGHEP01854 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGHEP01854 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGHEP01854 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGHEP01854 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGHEP01854 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGHEP01854 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGHEP01854 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGHEP01854 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHEP01854 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHEP01854 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHEP01854 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHEP01854 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGHEP01854 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGHEP01854 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGHEP01854 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGHEP01854 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGHEP01854 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGHEP01854 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHEP01854 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms