Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHV3-7P01780 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-7P01780 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHV3-7P01780 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHV3-7P01780 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-7P01780 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms