Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFT2D2O95562 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D2O95562 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D2O95562 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D2O95562 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D2O95562 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D2O95562 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D2O95562 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D2O95562 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D2O95562 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D2O95562 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D2O95562 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D2O95562 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D2O95562 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms