Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SEC24BO95487 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SEC24BO95487 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SEC24BO95487 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SEC24BO95487 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SEC24BO95487 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SEC24BO95487 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SEC24BO95487 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SEC24BO95487 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SEC24BO95487 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SEC24BO95487 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms