Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN7O94888 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN7O94888 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN7O94888 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN7O94888 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms