Protein–RNA interactions for Protein: O43847

NRDC, Nardilysin, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDCO43847 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRDCO43847 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRDCO43847 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRDCO43847 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRDCO43847 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRDCO43847 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRDCO43847 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRDCO43847 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRDCO43847 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRDCO43847 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRDCO43847 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRDCO43847 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRDCO43847 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRDCO43847 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRDCO43847 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRDCO43847 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NRDCO43847 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRDCO43847 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRDCO43847 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRDCO43847 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRDCO43847 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRDCO43847 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRDCO43847 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRDCO43847 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRDCO43847 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRDCO43847 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NRDCO43847 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NRDCO43847 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRDCO43847 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRDCO43847 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRDCO43847 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRDCO43847 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NRDCO43847 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRDCO43847 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRDCO43847 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRDCO43847 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDCO43847 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDCO43847 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDCO43847 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDCO43847 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDCO43847 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDCO43847 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDCO43847 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDCO43847 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRDCO43847 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRDCO43847 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRDCO43847 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRDCO43847 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRDCO43847 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRDCO43847 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRDCO43847 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRDCO43847 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRDCO43847 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRDCO43847 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRDCO43847 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRDCO43847 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRDCO43847 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRDCO43847 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRDCO43847 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRDCO43847 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRDCO43847 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRDCO43847 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRDCO43847 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRDCO43847 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRDCO43847 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRDCO43847 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRDCO43847 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRDCO43847 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRDCO43847 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRDCO43847 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRDCO43847 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRDCO43847 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRDCO43847 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRDCO43847 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRDCO43847 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRDCO43847 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRDCO43847 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRDCO43847 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NRDCO43847 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRDCO43847 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRDCO43847 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NRDCO43847 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRDCO43847 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NRDCO43847 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRDCO43847 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRDCO43847 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRDCO43847 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRDCO43847 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRDCO43847 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRDCO43847 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRDCO43847 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRDCO43847 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NRDCO43847 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRDCO43847 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRDCO43847 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRDCO43847 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRDCO43847 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRDCO43847 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRDCO43847 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRDCO43847 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms