Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDHDO14521 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDHDO14521 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDHDO14521 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDHDO14521 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDHDO14521 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDHDO14521 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDHDO14521 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDHDO14521 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDHDO14521 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHDO14521 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHDO14521 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHDO14521 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHDO14521 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHDO14521 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHDO14521 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHDO14521 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHDO14521 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDHDO14521 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDHDO14521 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDHDO14521 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDHDO14521 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHDO14521 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHDO14521 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHDO14521 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHDO14521 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHDO14521 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHDO14521 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDHDO14521 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDHDO14521 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDHDO14521 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDHDO14521 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDHDO14521 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDHDO14521 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDHDO14521 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHDO14521 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHDO14521 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHDO14521 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHDO14521 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHDO14521 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDHDO14521 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDHDO14521 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHDO14521 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHDO14521 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHDO14521 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHDO14521 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHDO14521 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SDHDO14521 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHDO14521 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHDO14521 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHDO14521 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHDO14521 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHDO14521 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHDO14521 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHDO14521 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHDO14521 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHDO14521 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHDO14521 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHDO14521 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDHDO14521 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHDO14521 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHDO14521 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHDO14521 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHDO14521 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHDO14521 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDHDO14521 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDHDO14521 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDHDO14521 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHDO14521 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHDO14521 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHDO14521 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHDO14521 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHDO14521 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHDO14521 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHDO14521 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHDO14521 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDHDO14521 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHDO14521 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHDO14521 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHDO14521 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHDO14521 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHDO14521 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHDO14521 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHDO14521 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHDO14521 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHDO14521 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHDO14521 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHDO14521 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHDO14521 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms