Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGRMC1O00264 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGRMC1O00264 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGRMC1O00264 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGRMC1O00264 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGRMC1O00264 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGRMC1O00264 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGRMC1O00264 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGRMC1O00264 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGRMC1O00264 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGRMC1O00264 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGRMC1O00264 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGRMC1O00264 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms