Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms