Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF25A6NGN4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF25A6NGN4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF25A6NGN4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF25A6NGN4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms