Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAV27A0A087WT01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAV27A0A087WT01 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAV27A0A087WT01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV27A0A087WT01 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV27A0A087WT01 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms