Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFLP07196 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFLP07196 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFLP07196 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFLP07196 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEFLP07196 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEFLP07196 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEFLP07196 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEFLP07196 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFLP07196 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFLP07196 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFLP07196 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms