Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms