Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms