Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 STB6YKL072W 2301 nt2.61□□□□□ -1.99
CSE4P36012 STF2YGR008C 255 nt2.61□□□□□ -1.99
CSE4P36012 UTP8YGR128C 2142 nt2.61□□□□□ -1.99
CSE4P36012 SFB2YNL049C 2631 nt2.61□□□□□ -1.99
CSE4P36012 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.6□□□□□ -1.99
CSE4P36012 YLL020CYLL020C 306 nt2.6□□□□□ -1.99
CSE4P36012 DGR1YNL130C-A 147 nt2.6□□□□□ -1.99
CSE4P36012 YPR097WYPR097W 3222 nt2.6□□□□□ -1.99
CSE4P36012 SEY1YOR165W 2331 nt2.59□□□□□ -1.99
CSE4P36012 BNI1YNL271C 5862 nt2.59□□□□□ -1.99
CSE4P36012 STH1YIL126W 4080 nt2.59□□□□□ -1.99
CSE4P36012 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.59□□□□□ -1.99
CSE4P36012 POL5YEL055C 3069 nt2.59□□□□□ -2
CSE4P36012 BFR2YDR299W 1605 nt2.58□□□□□ -2
CSE4P36012 QCR9YGR183C 201 nt2.58□□□□□ -2
CSE4P36012 TRM3YDL112W 4311 nt2.58□□□□□ -2
CSE4P36012 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.57□□□□□ -2
CSE4P36012 SEC16YPL085W 6588 nt2.57□□□□□ -2
CSE4P36012 YDR209CYDR209C 414 nt2.56□□□□□ -2
CSE4P36012 GCN2YDR283C 4980 nt2.55□□□□□ -2
CSE4P36012 NUT1YGL151W 3399 nt2.55□□□□□ -2
CSE4P36012 UTP21YLR409C 2820 nt2.55□□□□□ -2
CSE4P36012 TDA9YML081W 3756 nt2.54□□□□□ -2
CSE4P36012 SEC63YOR254C 1992 nt2.54□□□□□ -2
CSE4P36012 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.53□□□□□ -2
CSE4P36012 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.53□□□□□ -2
CSE4P36012 snR39BsnR39B 96 nt2.53□□□□□ -2
CSE4P36012 YOL098CYOL098C 3114 nt2.53□□□□□ -2
CSE4P36012 CSF1YLR087C 8877 nt2.53□□□□□ -2
CSE4P36012 SPP41YDR464W 4308 nt2.53□□□□□ -2
CSE4P36012 MSH6YDR097C 3729 nt2.53□□□□□ -2.01
CSE4P36012 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.52□□□□□ -2.01
CSE4P36012 RSM22YKL155C 1887 nt2.52□□□□□ -2.01
CSE4P36012 TOF1YNL273W 3717 nt2.52□□□□□ -2.01
CSE4P36012 YJR039WYJR039W 3366 nt2.51□□□□□ -2.01
CSE4P36012 EAF1YDR359C 2949 nt2.51□□□□□ -2.01
CSE4P36012 COA6YMR244C-A 315 nt2.51□□□□□ -2.01
CSE4P36012 HER1YOR227W 3741 nt2.51□□□□□ -2.01
CSE4P36012 COX5BYIL111W 456 nt2.5□□□□□ -2.01
CSE4P36012 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.5□□□□□ -2.01
CSE4P36012 ALY2YJL084C 3141 nt2.5□□□□□ -2.01
CSE4P36012 PEP1YBL017C 4740 nt2.5□□□□□ -2.01
CSE4P36012 TRA1YHR099W 11235 nt2.49□□□□□ -2.01
CSE4P36012 TBS1YBR150C 3285 nt2.48□□□□□ -2.01
CSE4P36012 RAD50YNL250W 3939 nt2.48□□□□□ -2.01
CSE4P36012 TAH1YCR060W 336 nt2.48□□□□□ -2.01
CSE4P36012 PAN2YGL094C 3348 nt2.47□□□□□ -2.01
CSE4P36012 BPH1YCR032W 6504 nt2.47□□□□□ -2.01
CSE4P36012 YLR419WYLR419W 4308 nt2.46□□□□□ -2.01
CSE4P36012 UBR2YLR024C 5619 nt2.46□□□□□ -2.02
CSE4P36012 EMC5YIL027C 426 nt2.46□□□□□ -2.02
CSE4P36012 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.46□□□□□ -2.02
CSE4P36012 RCO1YMR075W 2055 nt2.46□□□□□ -2.02
CSE4P36012 NUP157YER105C 4176 nt2.45□□□□□ -2.02
CSE4P36012 USO1YDL058W 5373 nt2.45□□□□□ -2.02
CSE4P36012 MMS4YBR098W 2076 nt2.45□□□□□ -2.02
CSE4P36012 MYO4YAL029C 4416 nt2.44□□□□□ -2.02
CSE4P36012 TOR2YKL203C 7425 nt2.44□□□□□ -2.02
CSE4P36012 SEC31YDL195W 3822 nt2.43□□□□□ -2.02
CSE4P36012 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.43□□□□□ -2.02
CSE4P36012 YAR009CYAR009C 3591 nt2.42□□□□□ -2.02
CSE4P36012 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.41□□□□□ -2.02
CSE4P36012 YML002WYML002W 2214 nt2.4□□□□□ -2.03
CSE4P36012 SIR4YDR227W 4077 nt2.39□□□□□ -2.03
CSE4P36012 FAB1YFR019W 6837 nt2.39□□□□□ -2.03
CSE4P36012 SMC1YFL008W 3678 nt2.39□□□□□ -2.03
CSE4P36012 YMR045CYMR045C 5268 nt2.37□□□□□ -2.03
CSE4P36012 IRC20YLR247C 4671 nt2.37□□□□□ -2.03
CSE4P36012 SLX4YLR135W 2247 nt2.37□□□□□ -2.03
CSE4P36012 RTP1YMR185W 2946 nt2.37□□□□□ -2.03
CSE4P36012 snR14snR14 160 nt2.36□□□□□ -2.03
CSE4P36012 SMC4YLR086W 4257 nt2.35□□□□□ -2.03
CSE4P36012 FKS1YLR342W 5631 nt2.35□□□□□ -2.03
CSE4P36012 ATG9YDL149W 2994 nt2.34□□□□□ -2.03
CSE4P36012 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.34□□□□□ -2.03
CSE4P36012 COG6YNL041C 2520 nt2.34□□□□□ -2.04
CSE4P36012 SEC21YNL287W 2808 nt2.34□□□□□ -2.04
CSE4P36012 PDR8YLR266C 2106 nt2.33□□□□□ -2.04
CSE4P36012 YLR041WYLR041W 321 nt2.33□□□□□ -2.04
CSE4P36012 UBP2YOR124C 3819 nt2.33□□□□□ -2.04
CSE4P36012 NEO1YIL048W 3456 nt2.32□□□□□ -2.04
CSE4P36012 snR81snR81 201 nt2.31□□□□□ -2.04
CSE4P36012 FYV10YIL097W 1551 nt2.31□□□□□ -2.04
CSE4P36012 MYO2YOR326W 4725 nt2.3□□□□□ -2.04
CSE4P36012 YDR210WYDR210W 228 nt2.3□□□□□ -2.04
CSE4P36012 NOP9YJL010C 2001 nt2.3□□□□□ -2.04
CSE4P36012 SKI3YPR189W 4299 nt2.3□□□□□ -2.04
CSE4P36012 YLR232WYLR232W 348 nt2.29□□□□□ -2.04
CSE4P36012 KAP120YPL125W 3099 nt2.29□□□□□ -2.04
CSE4P36012 KCS1YDR017C 3153 nt2.28□□□□□ -2.04
CSE4P36012 snR45snR45 172 nt2.28□□□□□ -2.04
CSE4P36012 MGA2YIR033W 3342 nt2.27□□□□□ -2.05
CSE4P36012 KAP122YGL016W 3246 nt2.27□□□□□ -2.05
CSE4P36012 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.27□□□□□ -2.05
CSE4P36012 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.27□□□□□ -2.05
CSE4P36012 STO1YMR125W 2586 nt2.25□□□□□ -2.05
CSE4P36012 NUP192YJL039C 5052 nt2.25□□□□□ -2.05
CSE4P36012 RGA1YOR127W 3024 nt2.24□□□□□ -2.05
CSE4P36012 SET3YKR029C 2256 nt2.24□□□□□ -2.05
CSE4P36012 snR190snR190 190 nt2.24□□□□□ -2.05
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