Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO3A2RU48 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms