Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms