Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTP4A2Q12974 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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