Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 CDC31YOR257W 486 nt1.22□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 CLU1YMR012W 3834 nt1.22□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 SEC3YER008C 4011 nt1.22□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 SET3YKR029C 2256 nt1.22□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 SLD3YGL113W 2007 nt1.22□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.21□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 RPL34BYIL052C 366 nt1.21□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.21□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.21□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 YDR048CYDR048C 315 nt1.2□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 OST1YJL002C 1431 nt1.2□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 PDE2YOR360C 1581 nt1.2□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 YLL007CYLL007C 1998 nt1.19□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 YDL206WYDL206W 2289 nt1.19□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 PTP2YOR208W 2253 nt1.19□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 STO1YMR125W 2586 nt1.19□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 PAN2YGL094C 3348 nt1.19□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.19□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 EAF1YDR359C 2949 nt1.19□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 YCK3YER123W 1575 nt1.17□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.17□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 STB6YKL072W 2301 nt1.17□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 CDC39YCR093W 6327 nt1.16□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 AHC1YOR023C 1701 nt1.16□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 YPL225WYPL225W 441 nt1.16□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 CDC25YLR310C 4770 nt1.16□□□□□ -2.22
VAM3Q12241 YAR009CYAR009C 3591 nt1.15□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 YDR521WYDR521W 336 nt1.15□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.15□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 HMRA2YCR096C 360 nt1.14□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.14□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 LAA1YJL207C 6045 nt1.13□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 ROM2YLR371W 4071 nt1.13□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 snR36snR36 182 nt1.13□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 YKL118WYKL118W 312 nt1.12□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 APL1YJR005W 2103 nt1.12□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 NUP157YER105C 4176 nt1.11□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 HTL1YCR020W-B 237 nt1.11□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 YBR206WYBR206W 324 nt1.11□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 SPO75YLL005C 2607 nt1.11□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 WAR1YML076C 2835 nt1.11□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.1□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.1□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.1□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.1□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.1□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.1□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.1□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 YHL042WYHL042W 453 nt1.1□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 YKL136WYKL136W 399 nt1.1□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 MSH3YCR092C 3057 nt1.09□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 SSS1YDR086C 243 nt1.09□□□□□ -2.23
VAM3Q12241 DBP6YNR038W 1890 nt1.09□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 NHP2YDL208W 471 nt1.08□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YFL032WYFL032W 321 nt1.08□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 ANS1YHR126C 480 nt1.08□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 RPS25BYLR333C 327 nt1.08□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 RPL33BYOR234C 324 nt1.08□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YDR413CYDR413C 576 nt1.07□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YFL063WYFL063W 456 nt1.07□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YJL120WYJL120W 324 nt1.07□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YGL149WYGL149W 306 nt1.06□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.06□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YBR064WYBR064W 429 nt1.06□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YER097WYER097W 330 nt1.05□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YMR321CYMR321C 318 nt1.05□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.05□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 BUD3YCL014W 4911 nt1.05□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YJR029WYJR029W 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 SPO21YOL091W 1830 nt1.04□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 Q0142Q0142 177 nt1.04□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YIL032CYIL032C 357 nt1.04□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 RPL39YJL189W 156 nt1.04□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 NST1YNL091W 3723 nt1.04□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 SMC1YFL008W 3678 nt1.03□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YDR344CYDR344C 444 nt1.03□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.03□□□□□ -2.24
VAM3Q12241 snR60snR60 104 nt1.02□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 INA22YIR024C 651 nt1.02□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 STE5YDR103W 2754 nt1.01□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 SPT7YBR081C 3999 nt1.01□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 OLI1Q0130 231 nt1.01□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 ECM12YHR021W-A 456 nt1.01□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 GEA2YEL022W 4380 nt1.01□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 VIK1YPL253C 1944 nt1□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 KAP120YPL125W 3099 nt1□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 COG8YML071C 1824 nt1□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 ISD11YER048W-A 285 nt0.99□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 ALG13YGL047W 609 nt0.99□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 RPS27BYHR021C 249 nt0.99□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.99□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.99□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 YOR218CYOR218C 420 nt0.98□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 YDL196WYDL196W 330 nt0.97□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 CSE2YNR010W 450 nt0.97□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 MCM10YIL150C 1716 nt0.97□□□□□ -2.25
VAM3Q12241 YGR130CYGR130C 2451 nt0.96□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 NOP9YJL010C 2001 nt0.95□□□□□ -2.26
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