Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 SMC4YLR086W 4257 nt1.76□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 SBE22YHR103W 2559 nt1.76□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 CLU1YMR012W 3834 nt1.76□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 PTP2YOR208W 2253 nt1.75□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 SLX4YLR135W 2247 nt1.75□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 snR8snR8 190 nt1.75□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.75□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.75□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 COG4YPR105C 2586 nt1.75□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 SXM1YDR395W 2835 nt1.75□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 PKH2YOL100W 3246 nt1.74□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 VPS15YBR097W 4365 nt1.73□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 BRR2YER172C 6492 nt1.73□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 YLL007CYLL007C 1998 nt1.73□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 YDR366CYDR366C 399 nt1.73□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 YMR321CYMR321C 318 nt1.73□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 YBR174CYBR174C 315 nt1.73□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 TRM3YDL112W 4311 nt1.73□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 ALY2YJL084C 3141 nt1.73□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 EST2YLR318W 2655 nt1.72□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 IRA1YBR140C 9279 nt1.72□□□□□ -2.13
SLX4Q12098 RPS27BYHR021C 249 nt1.71□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 RPS25BYLR333C 327 nt1.71□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YOR218CYOR218C 420 nt1.71□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 SPO75YLL005C 2607 nt1.71□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 PMD1YER132C 5262 nt1.71□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 AIM44YPL158C 2277 nt1.7□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 MSN5YDR335W 3675 nt1.7□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 snR49snR49 165 nt1.7□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 PBY1YBR094W 2262 nt1.7□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YLR419WYLR419W 4308 nt1.7□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 PDE2YOR360C 1581 nt1.69□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.69□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.68□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YJL120WYJL120W 324 nt1.68□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.68□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.68□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 IES4YOR189W 351 nt1.68□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YBR064WYBR064W 429 nt1.68□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 AZF1YOR113W 2745 nt1.68□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YGL052WYGL052W 306 nt1.67□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 GPG1YGL121C 381 nt1.67□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 SPO21YOL091W 1830 nt1.67□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 SWI4YER111C 3282 nt1.67□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 IFH1YLR223C 3258 nt1.67□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YDR521WYDR521W 336 nt1.66□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.66□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 YOR015WYOR015W 360 nt1.66□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 MMS4YBR098W 2076 nt1.66□□□□□ -2.14
SLX4Q12098 CHS1YNL192W 3396 nt1.65□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 snR14snR14 160 nt1.65□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 PIP2YOR363C 2991 nt1.65□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 SPC110YDR356W 2835 nt1.65□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 YDL206WYDL206W 2289 nt1.64□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.63□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 POL5YEL055C 3069 nt1.63□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 PAN2YGL094C 3348 nt1.63□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 ROM2YLR371W 4071 nt1.62□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 snR55snR55 98 nt1.62□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 PFD1YJL179W 330 nt1.62□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.62□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.62□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 PIK1YNL267W 3201 nt1.62□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 NUP145YGL092W 3954 nt1.62□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 FIG4YNL325C 2640 nt1.61□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 MCM10YIL150C 1716 nt1.61□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 YBR206WYBR206W 324 nt1.61□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 PET127YOR017W 2403 nt1.61□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 SEC3YER008C 4011 nt1.61□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 FYV8YGR196C 2454 nt1.6□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.6□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 CDC31YOR257W 486 nt1.6□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 YPR092WYPR092W 306 nt1.6□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 NUP192YJL039C 5052 nt1.6□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 SSK2YNR031C 4740 nt1.59□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 ABF2YMR072W 552 nt1.59□□□□□ -2.15
SLX4Q12098 CAT8YMR280C 4302 nt1.59□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 YGL041CYGL041C 204 nt1.58□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 APL3YBL037W 3078 nt1.58□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 YLL020CYLL020C 306 nt1.57□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 TRM732YMR259C 4263 nt1.57□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 SLD3YGL113W 2007 nt1.56□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 snR80snR80 171 nt1.56□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 SET3YKR029C 2256 nt1.55□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 SEC21YNL287W 2808 nt1.54□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 YAR009CYAR009C 3591 nt1.54□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 NUP188YML103C 4968 nt1.54□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 RRT15YLR162W-A 189 nt1.54□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 STO1YMR125W 2586 nt1.54□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 SMC1YFL008W 3678 nt1.53□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 AHC1YOR023C 1701 nt1.53□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.53□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 HKR1YDR420W 5409 nt1.53□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 CDC25YLR310C 4770 nt1.53□□□□□ -2.16
SLX4Q12098 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.52□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 ECM12YHR021W-A 456 nt1.52□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.52□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 SGF11YPL047W 300 nt1.52□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 CCH1YGR217W 6120 nt1.51□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 snR74snR74 88 nt1.51□□□□□ -2.17
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