Protein–RNA interactions for Protein: Q12079

YPR027C, Uncharacterized membrane protein YPR027C, yeastyeast

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR027CQ12079 BPH1YCR032W 6504 nt1.78□□□□□ -2.12
YPR027CQ12079 KAP122YGL016W 3246 nt1.77□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 RAD50YNL250W 3939 nt1.77□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 YDR521WYDR521W 336 nt1.77□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 ABF2YMR072W 552 nt1.77□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 COA6YMR244C-A 315 nt1.77□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.77□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 COF1YLL050C 432 nt1.76□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.76□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 ALK1YGL021W 2283 nt1.76□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 PKH2YOL100W 3246 nt1.76□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 SPG3YDR504C 384 nt1.75□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 SEC5YDR166C 2916 nt1.75□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 GCN2YDR283C 4980 nt1.75□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 IRC20YLR247C 4671 nt1.74□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 snR80snR80 171 nt1.74□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 YGL217CYGL217C 342 nt1.74□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 VPS55YJR044C 423 nt1.74□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 YBR174CYBR174C 315 nt1.74□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 MON2YNL297C 4911 nt1.74□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 SLX4YLR135W 2247 nt1.73□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 YLR419WYLR419W 4308 nt1.73□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 CDC36YDL165W 576 nt1.73□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.73□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 GPG1YGL121C 381 nt1.73□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 YOR376WYOR376W 369 nt1.73□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 YPR092WYPR092W 306 nt1.73□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 NCA2YPR155C 1851 nt1.73□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 NUP192YJL039C 5052 nt1.72□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 PBY1YBR094W 2262 nt1.72□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 YGL041CYGL041C 204 nt1.72□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.72□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 MCM10YIL150C 1716 nt1.71□□□□□ -2.13
YPR027CQ12079 PAN2YGL094C 3348 nt1.71□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 YLR422WYLR422W 5799 nt1.7□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 YOR093CYOR093C 4947 nt1.7□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 YLL054CYLL054C 2532 nt1.7□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 YHR210CYHR210C 1026 nt1.7□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 SMC4YLR086W 4257 nt1.7□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 YLR140WYLR140W 327 nt1.7□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.7□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 MYO2YOR326W 4725 nt1.7□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 YBR206WYBR206W 324 nt1.7□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 BST1YFL025C 3090 nt1.69□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 YOR019WYOR019W 2193 nt1.69□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 BRR2YER172C 6492 nt1.69□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 MMS4YBR098W 2076 nt1.68□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.67□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 RRT15YLR162W-A 189 nt1.67□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 SGF11YPL047W 300 nt1.67□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 NPR2YEL062W 1848 nt1.66□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 CAT8YMR280C 4302 nt1.66□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 BLI1YKL061W 342 nt1.66□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 JLP2YMR132C 627 nt1.66□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 AIM44YPL158C 2277 nt1.66□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 YDL206WYDL206W 2289 nt1.65□□□□□ -2.14
YPR027CQ12079 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.64□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.64□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 snR14snR14 160 nt1.64□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 DNF3YMR162C 4971 nt1.64□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 snR74snR74 88 nt1.63□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.63□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 TRM732YMR259C 4263 nt1.63□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 PIP2YOR363C 2991 nt1.62□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 CLU1YMR012W 3834 nt1.62□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 PFD1YJL179W 330 nt1.62□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 CDC31YOR257W 486 nt1.62□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 SWI4YER111C 3282 nt1.62□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 SBE22YHR103W 2559 nt1.62□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 YKU70YMR284W 1809 nt1.61□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.61□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 APQ12YIL040W 417 nt1.61□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.61□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.61□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 SLD3YGL113W 2007 nt1.61□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 MEC1YBR136W 7107 nt1.61□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 EST2YLR318W 2655 nt1.6□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 YOR302WYOR302W 78 nt1.6□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 AHC1YOR023C 1701 nt1.6□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 ROM2YLR371W 4071 nt1.59□□□□□ -2.15
YPR027CQ12079 LRE1YCL051W 1752 nt1.59□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 YAR009CYAR009C 3591 nt1.59□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 VPS15YBR097W 4365 nt1.58□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 ECM12YHR021W-A 456 nt1.58□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 CHS1YNL192W 3396 nt1.58□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 MSN5YDR335W 3675 nt1.58□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 SET3YKR029C 2256 nt1.57□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 FIG4YNL325C 2640 nt1.57□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 POL5YEL055C 3069 nt1.57□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 APL3YBL037W 3078 nt1.57□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.57□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 AZF1YOR113W 2745 nt1.56□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 ISD11YER048W-A 285 nt1.56□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 NUP145YGL092W 3954 nt1.56□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 SXM1YDR395W 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.55□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.55□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 PMD1YER132C 5262 nt1.55□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 STO1YMR125W 2586 nt1.54□□□□□ -2.16
YPR027CQ12079 CDC25YLR310C 4770 nt1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.9 ms