Protein–RNA interactions for Protein: Q08968

FMP40, UPF0061 protein FMP40, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FMP40Q08968 EST2YLR318W 2655 nt1.42□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 PET127YOR017W 2403 nt1.41□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 SSS1YDR086C 243 nt1.41□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 SPT21YMR179W 2277 nt1.41□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 MSH3YCR092C 3057 nt1.41□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 CUL3YGR003W 2235 nt1.4□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.4□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.4□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 IFH1YLR223C 3258 nt1.4□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 SPO75YLL005C 2607 nt1.39□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 PKH2YOL100W 3246 nt1.39□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 YIL032CYIL032C 357 nt1.39□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 LAA1YJL207C 6045 nt1.38□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 PIP2YOR363C 2991 nt1.38□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 AZF1YOR113W 2745 nt1.38□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 YLL007CYLL007C 1998 nt1.38□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 SWI4YER111C 3282 nt1.37□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 NUP188YML103C 4968 nt1.37□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 SLD3YGL113W 2007 nt1.37□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 INA22YIR024C 651 nt1.37□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 YJL015CYJL015C 285 nt1.37□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 PTP2YOR208W 2253 nt1.37□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 snR60snR60 104 nt1.36□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 snR65snR65 100 nt1.36□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 YDR521WYDR521W 336 nt1.36□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 PFD1YJL179W 330 nt1.36□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 MMS4YBR098W 2076 nt1.36□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 MSN5YDR335W 3675 nt1.35□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 GPG1YGL121C 381 nt1.35□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 CDC31YOR257W 486 nt1.35□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.35□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 APL3YBL037W 3078 nt1.35□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 AIM44YPL158C 2277 nt1.35□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 HMRA2YCR096C 360 nt1.34□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 YHL042WYHL042W 453 nt1.34□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 YJL120WYJL120W 324 nt1.34□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 YBR206WYBR206W 324 nt1.34□□□□□ -2.19
FMP40Q08968 YDL206WYDL206W 2289 nt1.34□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 SET3YKR029C 2256 nt1.33□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 RSM22YKL155C 1887 nt1.33□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 FIG4YNL325C 2640 nt1.33□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 PAN2YGL094C 3348 nt1.33□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 ALG13YGL047W 609 nt1.33□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.33□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 RPS25BYLR333C 327 nt1.33□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 COG8YML071C 1824 nt1.33□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 PBY1YBR094W 2262 nt1.32□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 SPO21YOL091W 1830 nt1.32□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.32□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.32□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.32□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 VIK1YPL253C 1944 nt1.32□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 RAD9YDR217C 3930 nt1.32□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 STO1YMR125W 2586 nt1.31□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.3□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 YMR321CYMR321C 318 nt1.3□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 PDE2YOR360C 1581 nt1.3□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 NUP145YGL092W 3954 nt1.29□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 CDC39YCR093W 6327 nt1.29□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 YAR009CYAR009C 3591 nt1.29□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.29□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 YLL020CYLL020C 306 nt1.29□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 RRT15YLR162W-A 189 nt1.29□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 CSE2YNR010W 450 nt1.28□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 RAD61YDR014W 1944 nt1.28□□□□□ -2.2
FMP40Q08968 CDC36YDL165W 576 nt1.27□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 EAF1YDR359C 2949 nt1.27□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YER181CYER181C 324 nt1.26□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 RPS27BYHR021C 249 nt1.26□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YNL028WYNL028W 318 nt1.26□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 STB6YKL072W 2301 nt1.26□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YGR069WYGR069W 336 nt1.25□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.25□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YBR064WYBR064W 429 nt1.25□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.24□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 CDC25YLR310C 4770 nt1.24□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 AHC1YOR023C 1701 nt1.23□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.23□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YOR015WYOR015W 360 nt1.23□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YOR218CYOR218C 420 nt1.23□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 CLU1YMR012W 3834 nt1.23□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 SEC3YER008C 4011 nt1.22□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.22□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 IES4YOR189W 351 nt1.22□□□□□ -2.21
FMP40Q08968 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.21□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 WAR1YML076C 2835 nt1.21□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 NUP157YER105C 4176 nt1.21□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.2□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.19□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.19□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.19□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.19□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.19□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.19□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.19□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 ECM12YHR021W-A 456 nt1.19□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.19□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 IML1YJR138W 4755 nt1.18□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 ROM2YLR371W 4071 nt1.18□□□□□ -2.22
FMP40Q08968 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 98.5 ms