Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 COG4YPR105C 2586 nt1.46□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 COF1YLL050C 432 nt1.46□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 RPS25BYLR333C 327 nt1.46□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YMR321CYMR321C 318 nt1.46□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.46□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 IES4YOR189W 351 nt1.46□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 ALK1YGL021W 2283 nt1.46□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 SLI15YBR156C 2097 nt1.46□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 UFD2YDL190C 2886 nt1.45□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YDR521WYDR521W 336 nt1.45□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YGL217CYGL217C 342 nt1.45□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 RPS27BYHR021C 249 nt1.45□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 ABF2YMR072W 552 nt1.45□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.45□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 KAP122YGL016W 3246 nt1.45□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 POL5YEL055C 3069 nt1.44□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 SMC4YLR086W 4257 nt1.44□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.44□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YBR174CYBR174C 315 nt1.44□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 MDS3YGL197W 4464 nt1.44□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 CUL3YGR003W 2235 nt1.44□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 CTF4YPR135W 2784 nt1.44□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 TRM732YMR259C 4263 nt1.43□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YLL007CYLL007C 1998 nt1.43□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 BRR2YER172C 6492 nt1.43□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 SLX4YLR135W 2247 nt1.43□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 PTP2YOR208W 2253 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 SSK2YNR031C 4740 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 IFH1YLR223C 3258 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 VPS55YJR044C 423 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 COA6YMR244C-A 315 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YOR218CYOR218C 420 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 snR14snR14 160 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YBR206WYBR206W 324 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YOR019WYOR019W 2193 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 PKH2YOL100W 3246 nt1.42□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 SEC5YDR166C 2916 nt1.41□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 NPR2YEL062W 1848 nt1.41□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 snR55snR55 98 nt1.41□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 PMD1YER132C 5262 nt1.41□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YCS4YLR272C 3531 nt1.41□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 ALY2YJL084C 3141 nt1.4□□□□□ -2.18
SSK1Q07084 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.4□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 YOR376WYOR376W 369 nt1.4□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 YPR092WYPR092W 306 nt1.4□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 SXM1YDR395W 2835 nt1.4□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 HKR1YDR420W 5409 nt1.4□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 snR74snR74 88 nt1.39□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 CDC36YDL165W 576 nt1.39□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 KIP1YBL063W 3336 nt1.39□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 NCA2YPR155C 1851 nt1.39□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 PET127YOR017W 2403 nt1.38□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 CCH1YGR217W 6120 nt1.38□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 GPG1YGL121C 381 nt1.38□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 ANS1YHR126C 480 nt1.38□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 YLR140WYLR140W 327 nt1.38□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 CHS1YNL192W 3396 nt1.38□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 TRM3YDL112W 4311 nt1.37□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 SPG3YDR504C 384 nt1.37□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 PBY1YBR094W 2262 nt1.37□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 SLD3YGL113W 2007 nt1.37□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 FYV8YGR196C 2454 nt1.36□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.36□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 SGF11YPL047W 300 nt1.36□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 ADR1YDR216W 3972 nt1.36□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 YDL206WYDL206W 2289 nt1.36□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 BST1YFL025C 3090 nt1.36□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 PFD1YJL179W 330 nt1.35□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 JLP2YMR132C 627 nt1.35□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 YOR302WYOR302W 78 nt1.35□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 FIG2YCR089W 4830 nt1.35□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 MCM10YIL150C 1716 nt1.35□□□□□ -2.19
SSK1Q07084 YLL054CYLL054C 2532 nt1.34□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 AHC1YOR023C 1701 nt1.33□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 MMS4YBR098W 2076 nt1.33□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 PAN2YGL094C 3348 nt1.32□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 CAT8YMR280C 4302 nt1.32□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.32□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 RRT15YLR162W-A 189 nt1.32□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 PIP2YOR363C 2991 nt1.31□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 SET3YKR029C 2256 nt1.3□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 APQ12YIL040W 417 nt1.3□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.3□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 NUP188YML103C 4968 nt1.3□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 YAR009CYAR009C 3591 nt1.3□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 FIG4YNL325C 2640 nt1.3□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 SWI4YER111C 3282 nt1.3□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 SEC21YNL287W 2808 nt1.3□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 APL3YBL037W 3078 nt1.29□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 SAC3YDR159W 3906 nt1.29□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.29□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 YLR422WYLR422W 5799 nt1.29□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 EST2YLR318W 2655 nt1.29□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 YKU70YMR284W 1809 nt1.29□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 AIM44YPL158C 2277 nt1.28□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 ECM12YHR021W-A 456 nt1.28□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 BLI1YKL061W 342 nt1.28□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.28□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 NUP192YJL039C 5052 nt1.28□□□□□ -2.2
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