Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 YDL206WYDL206W 2289 nt1.1□□□□□ -2.23
RRN9P53437 REV3YPL167C 4515 nt1.1□□□□□ -2.23
RRN9P53437 YLR422WYLR422W 5799 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN9P53437 APL1YJR005W 2103 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN9P53437 NUP145YGL092W 3954 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN9P53437 SET3YKR029C 2256 nt1.09□□□□□ -2.24
RRN9P53437 PTP2YOR208W 2253 nt1.09□□□□□ -2.24
RRN9P53437 PDE2YOR360C 1581 nt1.08□□□□□ -2.24
RRN9P53437 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.08□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.08□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.08□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YJR029WYJR029W 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YLL007CYLL007C 1998 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN9P53437 SLD3YGL113W 2007 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YDR048CYDR048C 315 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN9P53437 RPL34BYIL052C 366 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN9P53437 MDS3YGL197W 4464 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YJR011CYJR011C 786 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YAF9YNL107W 681 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN9P53437 MSH3YCR092C 3057 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN9P53437 LAA1YJL207C 6045 nt1.05□□□□□ -2.24
RRN9P53437 WAR1YML076C 2835 nt1.05□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.05□□□□□ -2.24
RRN9P53437 IFH1YLR223C 3258 nt1.05□□□□□ -2.24
RRN9P53437 ALY2YJL084C 3141 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN9P53437 NIP100YPL174C 2607 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN9P53437 VAM6YDL077C 3150 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN9P53437 ANS1YHR126C 480 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN9P53437 TAR1YLR154W-C 375 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN9P53437 OST1YJL002C 1431 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN9P53437 TRM732YMR259C 4263 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN9P53437 GEA2YEL022W 4380 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YAR009CYAR009C 3591 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN9P53437 HMRA2YCR096C 360 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN9P53437 EAF1YDR359C 2949 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YCK3YER123W 1575 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN9P53437 YDR102CYDR102C 333 nt1.01□□□□□ -2.25
RRN9P53437 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.01□□□□□ -2.25
RRN9P53437 ATP6Q0085 780 nt1.01□□□□□ -2.25
RRN9P53437 STB6YKL072W 2301 nt1.01□□□□□ -2.25
RRN9P53437 ROM2YLR371W 4071 nt1□□□□□ -2.25
RRN9P53437 CLU1YMR012W 3834 nt1□□□□□ -2.25
RRN9P53437 SPT7YBR081C 3999 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN9P53437 snR36snR36 182 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN9P53437 CDC39YCR093W 6327 nt0.98□□□□□ -2.25
RRN9P53437 YDR521WYDR521W 336 nt0.98□□□□□ -2.25
RRN9P53437 SIP4YJL089W 2490 nt0.98□□□□□ -2.25
RRN9P53437 PAN2YGL094C 3348 nt0.98□□□□□ -2.25
RRN9P53437 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN9P53437 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN9P53437 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN9P53437 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN9P53437 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN9P53437 YCS4YLR272C 3531 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN9P53437 DBP6YNR038W 1890 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN9P53437 TTI1YKL033W 3117 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN9P53437 SPO75YLL005C 2607 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YBR206WYBR206W 324 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN9P53437 SSS1YDR086C 243 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN9P53437 ECM12YHR021W-A 456 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN9P53437 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN9P53437 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YKL136WYKL136W 399 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YGL149WYGL149W 306 nt0.94□□□□□ -2.26
RRN9P53437 RPS25BYLR333C 327 nt0.94□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.94□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YPL225WYPL225W 441 nt0.94□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YGR130CYGR130C 2451 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN9P53437 BUD3YCL014W 4911 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YFL032WYFL032W 321 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YKL118WYKL118W 312 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YBR064WYBR064W 429 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN9P53437 NUP157YER105C 4176 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN9P53437 snR60snR60 104 nt0.92□□□□□ -2.26
RRN9P53437 NHP2YDL208W 471 nt0.92□□□□□ -2.26
RRN9P53437 OLI1Q0130 231 nt0.92□□□□□ -2.26
RRN9P53437 BEM2YER155C 6504 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN9P53437 HTL1YCR020W-B 237 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YDR413CYDR413C 576 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YHL042WYHL042W 453 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YIL032CYIL032C 357 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN9P53437 IML1YJR138W 4755 nt0.9□□□□□ -2.26
RRN9P53437 YMR321CYMR321C 318 nt0.9□□□□□ -2.27
RRN9P53437 IES4YOR189W 351 nt0.9□□□□□ -2.27
RRN9P53437 KAP120YPL125W 3099 nt0.9□□□□□ -2.27
RRN9P53437 SCC2YDR180W 4482 nt0.9□□□□□ -2.27
RRN9P53437 SPO21YOL091W 1830 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN9P53437 YDR344CYDR344C 444 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN9P53437 YJL120WYJL120W 324 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN9P53437 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN9P53437 CSE2YNR010W 450 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN9P53437 YOR218CYOR218C 420 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN9P53437 ISD11YER048W-A 285 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN9P53437 VIK1YPL253C 1944 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN9P53437 YDL196WYDL196W 330 nt0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.7 ms