Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAD1O00515 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAD1O00515 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAD1O00515 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAD1O00515 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAD1O00515 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAD1O00515 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAD1O00515 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms