Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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EXT1Q16394 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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EXT1Q16394 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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EXT1Q16394 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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EXT1Q16394 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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EXT1Q16394 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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EXT1Q16394 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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EXT1Q16394 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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EXT1Q16394 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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EXT1Q16394 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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