Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 RPB10YOR210W 213 nt1.55□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 YCL046WYCL046W 324 nt1.55□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 DNF3YMR162C 4971 nt1.55□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 HSL1YKL101W 4557 nt1.54□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 YGR250CYGR250C 2346 nt1.54□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 snR60snR60 104 nt1.54□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 YDL211CYDL211C 1119 nt1.54□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 ALG13YGL047W 609 nt1.54□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 SPC110YDR356W 2835 nt1.54□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 RAD61YDR014W 1944 nt1.54□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 RFX1YLR176C 2436 nt1.54□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 SXM1YDR395W 2835 nt1.53□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 YHL042WYHL042W 453 nt1.53□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 MUK1YPL070W 1839 nt1.53□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 CTF4YPR135W 2784 nt1.53□□□□□ -2.16
RBD2Q12270 MDM20YOL076W 2391 nt1.52□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 INP2YMR163C 2118 nt1.52□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 HIR3YJR140C 4947 nt1.52□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 FAB1YFR019W 6837 nt1.52□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 YGR265WYGR265W 411 nt1.52□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 YPR063CYPR063C 423 nt1.52□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 COG8YML071C 1824 nt1.52□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 CHS1YNL192W 3396 nt1.51□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 IRR1YIL026C 3453 nt1.51□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 SLY1YDR189W 2001 nt1.51□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.51□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.51□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 SDH2YLL041C 801 nt1.51□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 YLR255CYLR255C 354 nt1.51□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 LYS14YDR034C 2373 nt1.51□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 snR72snR72 98 nt1.5□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 SRP14YDL092W 441 nt1.5□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 HMI1YOL095C 2121 nt1.5□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 CFT1YDR301W 4074 nt1.5□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 FRK1YPL141C 2598 nt1.5□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 ZRG17YNR039C 1818 nt1.5□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 DCP2YNL118C 2913 nt1.49□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 ATG11YPR049C 3537 nt1.49□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.49□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 YGL041CYGL041C 204 nt1.49□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.49□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 POL5YEL055C 3069 nt1.49□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 BST1YFL025C 3090 nt1.49□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 MON2YNL297C 4911 nt1.48□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 snR80snR80 171 nt1.48□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 SSS1YDR086C 243 nt1.48□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 SPG3YDR504C 384 nt1.48□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 snR49snR49 165 nt1.48□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 YLR419WYLR419W 4308 nt1.48□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 YLL032CYLL032C 2478 nt1.47□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 ZIP1YDR285W 2628 nt1.47□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 SCW11YGL028C 1629 nt1.47□□□□□ -2.17
RBD2Q12270 FIG2YCR089W 4830 nt1.46□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 MAK10YEL053C 2202 nt1.46□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 IRE1YHR079C 3348 nt1.46□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.46□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 YBR064WYBR064W 429 nt1.46□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 SPT21YMR179W 2277 nt1.46□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 JLP2YMR132C 627 nt1.45□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 YBR174CYBR174C 315 nt1.45□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 LCD1YDR499W 2244 nt1.45□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 YLR140WYLR140W 327 nt1.44□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 ABF2YMR072W 552 nt1.44□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 YNL028WYNL028W 318 nt1.44□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 CSE2YNR010W 450 nt1.44□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.44□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 CCH1YGR217W 6120 nt1.44□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 MSC6YOR354C 2079 nt1.44□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 VIK1YPL253C 1944 nt1.44□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 CDC36YDL165W 576 nt1.43□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 INA22YIR024C 651 nt1.43□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 CTR9YOL145C 3234 nt1.43□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 SSK2YNR031C 4740 nt1.42□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 snR55snR55 98 nt1.42□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.42□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.42□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 YOL160WYOL160W 342 nt1.42□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 YLR422WYLR422W 5799 nt1.42□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 SAS3YBL052C 2496 nt1.42□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 MLH3YPL164C 2148 nt1.42□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 HKR1YDR420W 5409 nt1.41□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 MSH5YDL154W 2706 nt1.41□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 MPT5YGL178W 2580 nt1.41□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 PET127YOR017W 2403 nt1.41□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 SEC21YNL287W 2808 nt1.41□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 ZIP2YGL249W 2115 nt1.4□□□□□ -2.18
RBD2Q12270 YPP1YGR198W 2454 nt1.4□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 NCA2YPR155C 1851 nt1.4□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 YCK3YER123W 1575 nt1.4□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 YGL052WYGL052W 306 nt1.4□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.4□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 RLM1YPL089C 2031 nt1.4□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 IRA1YBR140C 9279 nt1.4□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.39□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 PFD1YJL179W 330 nt1.39□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 BLI1YKL061W 342 nt1.39□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.39□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 COA6YMR244C-A 315 nt1.39□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 YOR015WYOR015W 360 nt1.39□□□□□ -2.19
RBD2Q12270 NIP100YPL174C 2607 nt1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 144 ms