Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 RPL37BYDR500C 267 nt1.86□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 INA22YIR024C 651 nt1.86□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.86□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 VIK1YPL253C 1944 nt1.85□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 UBP1YDL122W 2430 nt1.85□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.85□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 YOR015WYOR015W 360 nt1.85□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 SPT21YMR179W 2277 nt1.85□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 CAT2YML042W 2013 nt1.84□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 ATG11YPR049C 3537 nt1.84□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.84□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.84□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.84□□□□□ -2.11
PDR8Q06149 SPC98YNL126W 2541 nt1.84□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 ADR1YDR216W 3972 nt1.84□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 NAM7YMR080C 2916 nt1.84□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 HSH155YMR288W 2916 nt1.84□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 NPR2YEL062W 1848 nt1.83□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 snR55snR55 98 nt1.83□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YGL052WYGL052W 306 nt1.83□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YHR210CYHR210C 1026 nt1.83□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 ENV11YGR071C 2583 nt1.83□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 SEC31YDL195W 3822 nt1.83□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 UTP21YLR409C 2820 nt1.82□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 MSH5YDL154W 2706 nt1.82□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.82□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.82□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YNL337WYNL337W 255 nt1.82□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 LRE1YCL051W 1752 nt1.82□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 ZIP1YDR285W 2628 nt1.82□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 LHS1YKL073W 2646 nt1.82□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 MSC6YOR354C 2079 nt1.81□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 SRP14YDL092W 441 nt1.81□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YMR321CYMR321C 318 nt1.81□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 PDE2YOR360C 1581 nt1.81□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.81□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.8□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YOL160WYOL160W 342 nt1.8□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 PET309YLR067C 2898 nt1.8□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 DCP2YNL118C 2913 nt1.8□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 MAK10YEL053C 2202 nt1.79□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 HER1YOR227W 3741 nt1.79□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 VPS54YDR027C 2670 nt1.79□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 PAU2YEL049W 363 nt1.79□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.79□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.79□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.79□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 IES4YOR189W 351 nt1.79□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YCK3YER123W 1575 nt1.78□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 APQ12YIL040W 417 nt1.78□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.78□□□□□ -2.12
PDR8Q06149 HIR3YJR140C 4947 nt1.78□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YNL144CYNL144C 2223 nt1.77□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.77□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 GPG1YGL121C 381 nt1.77□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 PFD1YJL179W 330 nt1.77□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 CTR9YOL145C 3234 nt1.77□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 SAS3YBL052C 2496 nt1.77□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YMR045CYMR045C 5268 nt1.77□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 APL2YKL135C 2181 nt1.76□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 SPO75YLL005C 2607 nt1.76□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 RLM1YPL089C 2031 nt1.76□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.76□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YOR302WYOR302W 78 nt1.76□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 ZIP2YGL249W 2115 nt1.76□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 PKH3YDR466W 2697 nt1.75□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.75□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.75□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YOR225WYOR225W 330 nt1.75□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 HSL1YKL101W 4557 nt1.75□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 MLH3YPL164C 2148 nt1.75□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 RPL34BYIL052C 366 nt1.74□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.74□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YPR092WYPR092W 306 nt1.74□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 RAD34YDR314C 2079 nt1.73□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 RPS27BYHR021C 249 nt1.73□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 PAM16YJL104W 450 nt1.73□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 PIG1YLR273C 1947 nt1.73□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.73□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 MAD1YGL086W 2250 nt1.73□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 FAB1YFR019W 6837 nt1.72□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.72□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YOR218CYOR218C 420 nt1.72□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 DGR2YKL121W 2559 nt1.72□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 IRE1YHR079C 3348 nt1.72□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 HMI1YOL095C 2121 nt1.72□□□□□ -2.13
PDR8Q06149 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.71□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 MYO2YOR326W 4725 nt1.71□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 TDA9YML081W 3756 nt1.71□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 SPO21YOL091W 1830 nt1.7□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 NOC3YLR002C 1992 nt1.7□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 snR74snR74 88 nt1.7□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 YJL120WYJL120W 324 nt1.7□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 RRT15YLR162W-A 189 nt1.7□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 TBS1YBR150C 3285 nt1.7□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 UBR2YLR024C 5619 nt1.7□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 PEP1YBL017C 4740 nt1.69□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 IRC20YLR247C 4671 nt1.69□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 RPS25BYLR333C 327 nt1.69□□□□□ -2.14
PDR8Q06149 YJR039WYJR039W 3366 nt1.69□□□□□ -2.14
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