Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms