Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms