Protein–RNA interactions for Protein: P40074

AVT6, Vacuolar amino acid transporter 6, yeastyeast

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT6P40074 AIM9YER080W 1884 nt1.01□□□□□ -2.25
AVT6P40074 SPO75YLL005C 2607 nt1.01□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YAR047CYAR047C 321 nt1.01□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YPR063CYPR063C 423 nt1.01□□□□□ -2.25
AVT6P40074 SAS3YBL052C 2496 nt1.01□□□□□ -2.25
AVT6P40074 SCW11YGL028C 1629 nt1□□□□□ -2.25
AVT6P40074 SLY1YDR189W 2001 nt1□□□□□ -2.25
AVT6P40074 SWI4YER111C 3282 nt1□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YKL063CYKL063C 504 nt1□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YKL202WYKL202W 582 nt1□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YLL020CYLL020C 306 nt1□□□□□ -2.25
AVT6P40074 UPS1YLR193C 528 nt1□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1□□□□□ -2.25
AVT6P40074 SPT21YMR179W 2277 nt1□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YCS4YLR272C 3531 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YKL083WYKL083W 615 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YML003WYML003W 873 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT6P40074 ISF1YMR081C 1017 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT6P40074 PRM3YPL192C 402 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YPL229WYPL229W 621 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT6P40074 PCF11YDR228C 1881 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT6P40074 CDC39YCR093W 6327 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT6P40074 PIP2YOR363C 2991 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT6P40074 SPT7YBR081C 3999 nt0.98□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YHL041WYHL041W 450 nt0.98□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YLR434CYLR434C 384 nt0.98□□□□□ -2.25
AVT6P40074 APL3YBL037W 3078 nt0.98□□□□□ -2.25
AVT6P40074 MPT5YGL178W 2580 nt0.97□□□□□ -2.25
AVT6P40074 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.97□□□□□ -2.25
AVT6P40074 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.97□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.97□□□□□ -2.25
AVT6P40074 RPB10YOR210W 213 nt0.97□□□□□ -2.25
AVT6P40074 YPL185WYPL185W 396 nt0.97□□□□□ -2.25
AVT6P40074 MUK1YPL070W 1839 nt0.96□□□□□ -2.26
AVT6P40074 EAF1YDR359C 2949 nt0.96□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YNL324WYNL324W 396 nt0.96□□□□□ -2.26
AVT6P40074 snR51snR51 107 nt0.96□□□□□ -2.26
AVT6P40074 STB6YKL072W 2301 nt0.95□□□□□ -2.26
AVT6P40074 ZIP2YGL249W 2115 nt0.95□□□□□ -2.26
AVT6P40074 snR72snR72 98 nt0.95□□□□□ -2.26
AVT6P40074 NPC2YDL046W 522 nt0.95□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.95□□□□□ -2.26
AVT6P40074 RRT1YBL048W 312 nt0.95□□□□□ -2.26
AVT6P40074 SLD3YGL113W 2007 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT6P40074 SIP4YJL089W 2490 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YER079WYER079W 633 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT6P40074 SET3YKR029C 2256 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT6P40074 LCD1YDR499W 2244 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT6P40074 IML1YJR138W 4755 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT6P40074 SWF1YDR126W 1011 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT6P40074 AGA2YGL032C 264 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YJL135WYJL135W 318 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YOR199WYOR199W 330 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YGR130CYGR130C 2451 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YJR003CYJR003C 1560 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YGR042WYGR042W 816 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YBR012CYBR012C 420 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT6P40074 ALY2YJL084C 3141 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT6P40074 FIG4YNL325C 2640 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT6P40074 ROM2YLR371W 4071 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT6P40074 SLI15YBR156C 2097 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT6P40074 NUP145YGL092W 3954 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YOL160WYOL160W 342 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT6P40074 PAC1YOR269W 1485 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT6P40074 STO1YMR125W 2586 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT6P40074 COG4YPR105C 2586 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT6P40074 AIM44YPL158C 2277 nt0.9□□□□□ -2.26
AVT6P40074 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YNL058CYNL058C 951 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YBR285WYBR285W 435 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT6P40074 TTI1YKL033W 3117 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT6P40074 BUD3YCL014W 4911 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT6P40074 SEC3YER008C 4011 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT6P40074 NST1YNL091W 3723 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT6P40074 INP2YMR163C 2118 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT6P40074 LEE1YPL054W 906 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YPL261CYPL261C 309 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT6P40074 MMS4YBR098W 2076 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT6P40074 PDE2YOR360C 1581 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT6P40074 RAD34YDR314C 2079 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT6P40074 ATG31YDR022C 591 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT6P40074 RPS20YHL015W 366 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YHR138CYHR138C 345 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.86□□□□□ -2.27
AVT6P40074 BSC3YLR465C 309 nt0.86□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YOR053WYOR053W 342 nt0.86□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.86□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT6P40074 SMC1YFL008W 3678 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT6P40074 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT6P40074 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT6P40074 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT6P40074 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT6P40074 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT6P40074 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46 ms