Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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