Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKN3Q16667 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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