Protein–RNA interactions for Protein: Q03973

HMO1, High mobility group protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMO1Q03973 INP2YMR163C 2118 nt2.34□□□□□ -2.03
HMO1Q03973 EDS1YBR033W 2760 nt2.34□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 VIK1YPL253C 1944 nt2.34□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 UBR1YGR184C 5853 nt2.34□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 NPR2YEL062W 1848 nt2.33□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 MUK1YPL070W 1839 nt2.33□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 LCD1YDR499W 2244 nt2.33□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 MRP10YDL045W-A 288 nt2.33□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 GIP3YPL137C 3831 nt2.33□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 SPT21YMR179W 2277 nt2.33□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 FKS3YMR306W 5358 nt2.32□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 PLC1YPL268W 2610 nt2.32□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 MSB1YOR188W 3414 nt2.32□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 NUP120YKL057C 3114 nt2.31□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 SLY1YDR189W 2001 nt2.31□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.31□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.31□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 CHC1YGL206C 4962 nt2.31□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.3□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.3□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.3□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 snR43snR43 209 nt2.3□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.3□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 ZRG8YER033C 3231 nt2.29□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 RFX1YLR176C 2436 nt2.29□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 RAV1YJR033C 4074 nt2.29□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 snR72snR72 98 nt2.29□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.29□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 EMP24YGL200C 612 nt2.29□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YMR321CYMR321C 318 nt2.29□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.29□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YFR016CYFR016C 3702 nt2.29□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 TOF1YNL273W 3717 nt2.29□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 SAP185YJL098W 3177 nt2.28□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YCR043CYCR043C 384 nt2.28□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 INA22YIR024C 651 nt2.28□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.28□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 YOR302WYOR302W 78 nt2.28□□□□□ -2.04
HMO1Q03973 PDE2YOR360C 1581 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 UBP2YOR124C 3819 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 BUB1YGR188C 3066 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 UFD4YKL010C 4452 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YGR151CYGR151C 336 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YJL182CYJL182C 318 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YOR015WYOR015W 360 nt2.27□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 DNA2YHR164C 4569 nt2.26□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 KOG1YHR186C 4674 nt2.26□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YDR286CYDR286C 345 nt2.26□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 PAU8YAL068C 363 nt2.26□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 PAU18YLL064C 363 nt2.26□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 PAU6YNR076W 363 nt2.26□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 PAU20YOL161C 363 nt2.26□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YCL046WYCL046W 324 nt2.26□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 PDR11YIL013C 4236 nt2.25□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 MNE1YOR350C 1992 nt2.25□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 SKP2YNL311C 2292 nt2.25□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 NUP100YKL068W 2880 nt2.25□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.25□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YRB1YDR002W 606 nt2.25□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.25□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.25□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 LYS14YDR034C 2373 nt2.25□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 CLN3YAL040C 1743 nt2.25□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 DCP2YNL118C 2913 nt2.24□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YEL014CYEL014C 306 nt2.24□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.24□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 TFC3YAL001C 3483 nt2.24□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 SLN1YIL147C 3663 nt2.23□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 INO80YGL150C 4470 nt2.23□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 MDM20YOL076W 2391 nt2.23□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 RPS17AYML024W 411 nt2.23□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 TFC8YPL007C 1767 nt2.23□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YLL032CYLL032C 2478 nt2.23□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 PET309YLR067C 2898 nt2.22□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 YPR092WYPR092W 306 nt2.22□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 TRS130YMR218C 3309 nt2.22□□□□□ -2.05
HMO1Q03973 VPS54YDR027C 2670 nt2.21□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 TIM9YEL020W-A 264 nt2.21□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 DGR1YNL130C-A 147 nt2.21□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 BNI1YNL271C 5862 nt2.21□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 STH1YIL126W 4080 nt2.21□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 PDR3YBL005W 2931 nt2.21□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 ZIP1YDR285W 2628 nt2.21□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 CDC60YPL160W 3273 nt2.2□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 SRP14YDL092W 441 nt2.2□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.2□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 OLI1Q0130 231 nt2.2□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.2□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 VPS55YJR044C 423 nt2.2□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 YNL338WYNL338W 159 nt2.2□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 TRL1YJL087C 2484 nt2.2□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 SEC5YDR166C 2916 nt2.2□□□□□ -2.06
HMO1Q03973 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.2□□□□□ -2.06
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