Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms