Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms