Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 CSE2YNR010W 450 nt2.26□□□□□ -2.05
SNF12P53628 SPO22YIL073C 2928 nt2.26□□□□□ -2.05
SNF12P53628 PXA2YKL188C 2562 nt2.26□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YPR097WYPR097W 3222 nt2.26□□□□□ -2.05
SNF12P53628 SLM1YIL105C 2061 nt2.26□□□□□ -2.05
SNF12P53628 STB4YMR019W 2850 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 LCD1YDR499W 2244 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 snR70snR70 164 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YGL052WYGL052W 306 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YNL114CYNL114C 372 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 RPB10YOR210W 213 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 GIP3YPL137C 3831 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 SMC6YLR383W 3345 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 CLN3YAL040C 1743 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 SET2YJL168C 2202 nt2.25□□□□□ -2.05
SNF12P53628 SWI5YDR146C 2130 nt2.24□□□□□ -2.05
SNF12P53628 MUK1YPL070W 1839 nt2.24□□□□□ -2.05
SNF12P53628 DNF1YER166W 4716 nt2.24□□□□□ -2.05
SNF12P53628 INP2YMR163C 2118 nt2.24□□□□□ -2.05
SNF12P53628 VTC3YPL019C 2508 nt2.24□□□□□ -2.05
SNF12P53628 CDC53YDL132W 2448 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 VIK1YPL253C 1944 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YJL135WYJL135W 318 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YJL182CYJL182C 318 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 NPR2YEL062W 1848 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 TOF1YNL273W 3717 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 RPH1YER169W 2391 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 IRC8YJL051W 2469 nt2.23□□□□□ -2.05
SNF12P53628 MGM1YOR211C 2646 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 SGS1YMR190C 4344 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 SLY1YDR189W 2001 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 SSS1YDR086C 243 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 snR43snR43 209 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 PLC1YPL268W 2610 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 SPT21YMR179W 2277 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 PDR3YBL005W 2931 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 MSB1YOR188W 3414 nt2.22□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.21□□□□□ -2.06
SNF12P53628 YGR151CYGR151C 336 nt2.21□□□□□ -2.06
SNF12P53628 BNI1YNL271C 5862 nt2.21□□□□□ -2.06
SNF12P53628 ZRG8YER033C 3231 nt2.21□□□□□ -2.06
SNF12P53628 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.2□□□□□ -2.06
SNF12P53628 YMR321CYMR321C 318 nt2.2□□□□□ -2.06
SNF12P53628 PDR11YIL013C 4236 nt2.19□□□□□ -2.06
SNF12P53628 IST2YBR086C 2841 nt2.19□□□□□ -2.06
SNF12P53628 BUB1YGR188C 3066 nt2.19□□□□□ -2.06
SNF12P53628 RFX1YLR176C 2436 nt2.19□□□□□ -2.06
SNF12P53628 EMP24YGL200C 612 nt2.18□□□□□ -2.06
SNF12P53628 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.18□□□□□ -2.06
SNF12P53628 YOR302WYOR302W 78 nt2.18□□□□□ -2.06
SNF12P53628 SLN1YIL147C 3663 nt2.18□□□□□ -2.06
SNF12P53628 PDE2YOR360C 1581 nt2.18□□□□□ -2.06
SNF12P53628 YCR043CYCR043C 384 nt2.17□□□□□ -2.06
SNF12P53628 YEL014CYEL014C 306 nt2.17□□□□□ -2.06
SNF12P53628 SAP185YJL098W 3177 nt2.17□□□□□ -2.06
SNF12P53628 RTT101YJL047C 2529 nt2.17□□□□□ -2.06
SNF12P53628 SSD1YDR293C 3753 nt2.16□□□□□ -2.06
SNF12P53628 YDR286CYDR286C 345 nt2.16□□□□□ -2.06
SNF12P53628 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.16□□□□□ -2.06
SNF12P53628 INA22YIR024C 651 nt2.16□□□□□ -2.06
SNF12P53628 YPP1YGR198W 2454 nt2.16□□□□□ -2.06
SNF12P53628 TFC3YAL001C 3483 nt2.15□□□□□ -2.07
SNF12P53628 snR72snR72 98 nt2.15□□□□□ -2.07
SNF12P53628 VPS55YJR044C 423 nt2.15□□□□□ -2.07
SNF12P53628 YOR015WYOR015W 360 nt2.15□□□□□ -2.07
SNF12P53628 TRL1YJL087C 2484 nt2.15□□□□□ -2.07
SNF12P53628 YLL032CYLL032C 2478 nt2.15□□□□□ -2.07
SNF12P53628 SCD5YOR329C 2619 nt2.15□□□□□ -2.07
SNF12P53628 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.14□□□□□ -2.07
SNF12P53628 YOL160WYOL160W 342 nt2.14□□□□□ -2.07
SNF12P53628 SEC16YPL085W 6588 nt2.14□□□□□ -2.07
SNF12P53628 SCP160YJL080C 3669 nt2.14□□□□□ -2.07
SNF12P53628 LYS14YDR034C 2373 nt2.14□□□□□ -2.07
SNF12P53628 MDM20YOL076W 2391 nt2.14□□□□□ -2.07
SNF12P53628 DCP2YNL118C 2913 nt2.14□□□□□ -2.07
SNF12P53628 OLI1Q0130 231 nt2.13□□□□□ -2.07
SNF12P53628 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.13□□□□□ -2.07
SNF12P53628 TFC8YPL007C 1767 nt2.13□□□□□ -2.07
SNF12P53628 RGA1YOR127W 3024 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 MNE1YOR350C 1992 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 USO1YDL058W 5373 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 Q0092Q0092 141 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 VPS8YAL002W 3825 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 PAU18YLL064C 363 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 RRT15YLR162W-A 189 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 YNL338WYNL338W 159 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 PAU6YNR076W 363 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 UBP2YOR124C 3819 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 YCL046WYCL046W 324 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 MET18YIL128W 3099 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 VPS54YDR027C 2670 nt2.12□□□□□ -2.07
SNF12P53628 STH1YIL126W 4080 nt2.11□□□□□ -2.07
SNF12P53628 CDC60YPL160W 3273 nt2.11□□□□□ -2.07
SNF12P53628 YPR092WYPR092W 306 nt2.11□□□□□ -2.07
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