Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2E1P29083 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms