Protein–RNA interactions for Protein: P19955

YMR31, 37S ribosomal protein YMR-31, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR31P19955 YIL029CYIL029C 429 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR31P19955 RPL16AYIL133C 600 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR31P19955 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR31P19955 CYC7YEL039C 342 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR31P19955 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR31P19955 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR31P19955 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR31P19955 SCC2YDR180W 4482 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR31P19955 SET3YKR029C 2256 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR31P19955 AIM9YER080W 1884 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR31P19955 snR84snR84 550 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR31P19955 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR31P19955 RIM20YOR275C 1986 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR31P19955 SCW11YGL028C 1629 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR31P19955 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR31P19955 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR31P19955 RUF22RUF22 515 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR31P19955 ALY2YJL084C 3141 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR31P19955 SHE9YDR393W 1371 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR31P19955 UBP3YER151C 2739 nt0.78□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YAR009CYAR009C 3591 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR31P19955 SWI6YLR182W 2412 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR31P19955 RTT102YGR275W 474 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR31P19955 SDH2YLL041C 801 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YNL050CYNL050C 813 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR31P19955 SMC1YFL008W 3678 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YDL206WYDL206W 2289 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YOR199WYOR199W 330 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YPR039WYPR039W 336 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR31P19955 TMA22YJR014W 597 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR31P19955 ENV11YGR071C 2583 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR31P19955 PDE2YOR360C 1581 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 FIG4YNL325C 2640 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 DOP1YDR141C 5097 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YAP3YHL009C 993 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 APQ13YJL075C 417 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 ILM1YJR118C 612 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 UPS1YLR193C 528 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 PAU24YBR301W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 APL2YKL135C 2181 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 PXA2YKL188C 2562 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 STO1YMR125W 2586 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 MMS4YBR098W 2076 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 SLY1YDR189W 2001 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YLL032CYLL032C 2478 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YIL059CYIL059C 366 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YKL044WYKL044W 321 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR31P19955 IRC16YPR038W 360 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR31P19955 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR31P19955 BER1YLR412W 825 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR31P19955 MXR1YER042W 555 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR31P19955 NBL1YHR199C-A 222 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR31P19955 ERP4YOR016C 624 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR31P19955 RCN2YOR220W 798 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR31P19955 LCD1YDR499W 2244 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR31P19955 RFX1YLR176C 2436 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR31P19955 YDL073WYDL073W 2955 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR31P19955 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR31P19955 RRT1YBL048W 312 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR31P19955 YDL196WYDL196W 330 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR31P19955 OCA6YDR067C 675 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR31P19955 PRE4YFR050C 801 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR31P19955 SVS1YPL163C 783 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR31P19955 SLD3YGL113W 2007 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR31P19955 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR31P19955 MRPL31YKL138C 396 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR31P19955 RPL32YBL092W 393 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR31P19955 SLI15YBR156C 2097 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR31P19955 YGL239CYGL239C 315 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR31P19955 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR31P19955 YPR153WYPR153W 423 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR31P19955 PRP16YKR086W 3216 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR31P19955 NPC2YDL046W 522 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YDR269CYDR269C 324 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR31P19955 WAR1YML076C 2835 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR31P19955 NHP2YDL208W 471 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR31P19955 SWF1YDR126W 1011 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR31P19955 ALG13YGL047W 609 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR31P19955 HUR1YGL168W 333 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YJR141WYJR141W 1044 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR31P19955 snR13snR13 124 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR31P19955 PAN2YGL094C 3348 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YDL016CYDL016C 303 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR31P19955 MET32YDR253C 576 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR31P19955 DBP6YNR038W 1890 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YDR521WYDR521W 336 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR31P19955 ISD11YER048W-A 285 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YGR025WYGR025W 303 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR31P19955 PHS1YJL097W 654 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR31P19955 IES4YOR189W 351 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR31P19955 PAM16YJL104W 450 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR31P19955 CMC4YMR194C-B 222 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR31P19955 SEC1YDR164C 2175 nt0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.5 ms