Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFLP07196 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEFLP07196 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEFLP07196 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEFLP07196 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEFLP07196 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEFLP07196 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEFLP07196 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEFLP07196 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEFLP07196 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NEFLP07196 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms