Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.38□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 REV3YPL167C 4515 nt2.38□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 BUD2YKL092C 3315 nt2.38□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 TOR1YJR066W 7413 nt2.37□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 CAT2YML042W 2013 nt2.37□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 MCD1YDL003W 1701 nt2.37□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 IRR1YIL026C 3453 nt2.37□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 RPL32YBL092W 393 nt2.37□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 YPL225WYPL225W 441 nt2.37□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 BNI1YNL271C 5862 nt2.37□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 ALK2YBL009W 2031 nt2.37□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 DFG16YOR030W 1860 nt2.37□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 STH1YIL126W 4080 nt2.37□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 SAP190YKR028W 3102 nt2.36□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.36□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 RPA34YJL148W 702 nt2.36□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.36□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 RGA1YOR127W 3024 nt2.36□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 HER1YOR227W 3741 nt2.35□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.35□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 GCN4YEL009C 846 nt2.35□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 PRE4YFR050C 801 nt2.35□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 ATP7YKL016C 525 nt2.35□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 YSY6YBR162W-A 198 nt2.35□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 YAF9YNL107W 681 nt2.34□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 YNL146WYNL146W 303 nt2.34□□□□□ -2.03
SLX4Q12098 TDA9YML081W 3756 nt2.34□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 PEX8YGR077C 1770 nt2.33□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 PLC1YPL268W 2610 nt2.33□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 RPL42BYHR141C 321 nt2.33□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 YKL118WYKL118W 312 nt2.33□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 RPL42AYNL162W 321 nt2.33□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 GUP1YGL084C 1683 nt2.33□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 UTP22YGR090W 3714 nt2.33□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 ATG9YDL149W 2994 nt2.33□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 COS111YBR203W 2775 nt2.32□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 ABM1YJR108W 372 nt2.32□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 TIM18YOR297C 579 nt2.32□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 IRC8YJL051W 2469 nt2.32□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 ARP7YPR034W 1434 nt2.32□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 NUP170YBL079W 4509 nt2.31□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 TFC8YPL007C 1767 nt2.31□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 YDR008CYDR008C 351 nt2.3□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 YIL059CYIL059C 366 nt2.3□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.3□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.3□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 HHT1YBR010W 411 nt2.3□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 YNL114CYNL114C 372 nt2.29□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 VPS34YLR240W 2628 nt2.29□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 YBP1YBR216C 2025 nt2.29□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 PAC1YOR269W 1485 nt2.28□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 YDR102CYDR102C 333 nt2.28□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 PDR8YLR266C 2106 nt2.28□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.28□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 CHC1YGL206C 4962 nt2.28□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 SGO1YOR073W 1773 nt2.28□□□□□ -2.04
SLX4Q12098 ELG1YOR144C 2376 nt2.28□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 RKM1YPL208W 1752 nt2.26□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 HCS1YKL017C 2052 nt2.26□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 YHL037CYHL037C 402 nt2.26□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 YHL041WYHL041W 450 nt2.26□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.26□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 MGA2YIR033W 3342 nt2.25□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 EFR3YMR212C 2349 nt2.25□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 NHP2YDL208W 471 nt2.25□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 YDR413CYDR413C 576 nt2.25□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.25□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 UBP2YOR124C 3819 nt2.24□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 FMP23YBR047W 528 nt2.24□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 NOP14YDL148C 2433 nt2.24□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 SWI6YLR182W 2412 nt2.24□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 UFD4YKL010C 4452 nt2.24□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 CFT2YLR115W 2580 nt2.24□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 SWI5YDR146C 2130 nt2.24□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 SEY1YOR165W 2331 nt2.24□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 YDL118WYDL118W 381 nt2.23□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.23□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 DGR1YNL130C-A 147 nt2.23□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 snR36snR36 182 nt2.23□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 YCL023CYCL023C 348 nt2.23□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 SSQ1YLR369W 1974 nt2.23□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 SEC63YOR254C 1992 nt2.23□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 EMP24YGL200C 612 nt2.22□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.22□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 YFR016CYFR016C 3702 nt2.21□□□□□ -2.05
SLX4Q12098 PXA2YKL188C 2562 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 SEC31YDL195W 3822 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 CSN9YDR179C 489 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YER097WYER097W 330 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YGR250CYGR250C 2346 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YOR199WYOR199W 330 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 SAR1YPL218W 573 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 KOG1YHR186C 4674 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 SAC3YDR159W 3906 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 BRE1YDL074C 2103 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 NOP53YPL146C 1368 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 CTR9YOL145C 3234 nt2.21□□□□□ -2.06
SLX4Q12098 OSH6YKR003W 1347 nt2.2□□□□□ -2.06
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