Protein–RNA interactions for Protein: Q08924

RTT10, Regulator of Ty1 transposition protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT10Q08924 LCL1YPL056C 306 nt2.83□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 IRR1YIL026C 3453 nt2.83□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 GEA1YJR031C 4227 nt2.82□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 MUK1YPL070W 1839 nt2.82□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 MGM1YOR211C 2646 nt2.82□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 PLC1YPL268W 2610 nt2.82□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 SWR1YDR334W 4545 nt2.82□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 PFD1YJL179W 330 nt2.82□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.82□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 INP2YMR163C 2118 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 RPH1YER169W 2391 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 SWI6YLR182W 2412 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YHL005CYHL005C 393 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YOR302WYOR302W 78 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 snR43snR43 209 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 VIK1YPL253C 1944 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 SMY2YBR172C 2223 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 PFF1YBR074W 2931 nt2.81□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 MRD1YPR112C 2664 nt2.8□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 VMR1YHL035C 4779 nt2.8□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 SSS1YDR086C 243 nt2.8□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.8□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YMR321CYMR321C 318 nt2.8□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 NAB6YML117W 3405 nt2.8□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 SET2YJL168C 2202 nt2.8□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YNL018CYNL018C 1839 nt2.79□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 PMR1YGL167C 2853 nt2.79□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 ZRG8YER033C 3231 nt2.79□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YGR151CYGR151C 336 nt2.79□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YOR015WYOR015W 360 nt2.79□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 NMD2YHR077C 3270 nt2.79□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 SLM1YIL105C 2061 nt2.78□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YKU80YMR106C 1890 nt2.78□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.78□□□□□ -1.96
RTT10Q08924 TOM1YDR457W 9807 nt2.77□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.77□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 YDR286CYDR286C 345 nt2.77□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 INA22YIR024C 651 nt2.77□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 BUB1YGR188C 3066 nt2.77□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 PRP8YHR165C 7242 nt2.77□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 ILS1YBL076C 3219 nt2.77□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 SPT21YMR179W 2277 nt2.76□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 YJL135WYJL135W 318 nt2.76□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 PTP3YER075C 2787 nt2.76□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 YIL169CYIL169C 2988 nt2.76□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 SEC7YDR170C 6030 nt2.76□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 RFX1YLR176C 2436 nt2.76□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 PDE2YOR360C 1581 nt2.75□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 snR70snR70 164 nt2.75□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 SWI5YDR146C 2130 nt2.75□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 BPT1YLL015W 4680 nt2.74□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 YCR043CYCR043C 384 nt2.74□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 RPB10YOR210W 213 nt2.74□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 SLY1YDR189W 2001 nt2.74□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 ESC1YMR219W 4977 nt2.73□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 TCB2YNL087W 3537 nt2.73□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 Q0092Q0092 141 nt2.73□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 TRS130YMR218C 3309 nt2.73□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 VTC3YPL019C 2508 nt2.72□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.72□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 VPS55YJR044C 423 nt2.72□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 YOL160WYOL160W 342 nt2.72□□□□□ -1.97
RTT10Q08924 SWA2YDR320C 2007 nt2.71□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 RRT15YLR162W-A 189 nt2.71□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 YPL216WYPL216W 3309 nt2.71□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 DNA2YHR164C 4569 nt2.71□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 LYS14YDR034C 2373 nt2.71□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 VPS54YDR027C 2670 nt2.7□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 SLH1YGR271W 5904 nt2.7□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 snR72snR72 98 nt2.7□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 PAU8YAL068C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 PAU18YLL064C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 PAU6YNR076W 363 nt2.7□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 PAU20YOL161C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.69□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 ECM29YHL030W 5607 nt2.69□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 HYP2YEL034W 474 nt2.69□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 EMP24YGL200C 612 nt2.69□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 RPS29AYLR388W 171 nt2.69□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 RPL33AYPL143W 324 nt2.69□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 MSB2YGR014W 3921 nt2.69□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 MET18YIL128W 3099 nt2.69□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 MPT5YGL178W 2580 nt2.68□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 FAR11YNL127W 2862 nt2.68□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.68□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.68□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.68□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.68□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.68□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.68□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 NUP100YKL068W 2880 nt2.68□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 YEL014CYEL014C 306 nt2.67□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.67□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 YPR092WYPR092W 306 nt2.67□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 YDR239CYDR239C 2364 nt2.67□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 MNE1YOR350C 1992 nt2.67□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 TOP2YNL088W 4287 nt2.66□□□□□ -1.98
RTT10Q08924 NIP100YPL174C 2607 nt2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.3 ms