Protein–RNA interactions for Protein: Q06333

CNL1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit CNL1, yeastyeast

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CNL1Q06333 GMC2YLR445W 567 nt0.25□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.25□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 RPS7BYNL096C 573 nt0.25□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 PXA2YKL188C 2562 nt0.24□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 YOR366WYOR366W 354 nt0.24□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 YOP1YPR028W 543 nt0.24□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.23□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 TIM8YJR135W-A 264 nt0.23□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 VPS63YLR261C 327 nt0.23□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 SPC2YML055W 537 nt0.23□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 SPR2YOR214C 711 nt0.23□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 ZIP1YDR285W 2628 nt0.23□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 SLD3YGL113W 2007 nt0.22□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 ATC1YDR184C 885 nt0.22□□□□□ -2.37
CNL1Q06333 VPS52YDR484W 1926 nt0.21□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.21□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.21□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 YAR009CYAR009C 3591 nt0.21□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 SCW11YGL028C 1629 nt0.2□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.2□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.2□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.2□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 URM1YIL008W 300 nt0.2□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.2□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 YPR170CYPR170C 336 nt0.2□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 snR44snR44 211 nt0.2□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 PRE4YFR050C 801 nt0.19□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 YPR147CYPR147C 915 nt0.19□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 SHE9YDR393W 1371 nt0.19□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 ISD11YER048W-A 285 nt0.18□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.18□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 HTD2YHR067W 843 nt0.18□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 LSM12YHR121W 564 nt0.18□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.18□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 SWI5YDR146C 2130 nt0.17□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 ALY2YJL084C 3141 nt0.17□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 ATG16YMR159C 453 nt0.17□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 SUS1YBR111W-A 291 nt0.17□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.16□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 KAR1YNL188W 1302 nt0.16□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 PAU12YGR294W 363 nt0.16□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 GIM5YML094W 492 nt0.16□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 FMP27YLR454W 7887 nt0.16□□□□□ -2.38
CNL1Q06333 RMD6YEL072W 696 nt0.15□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 SNO3YFL060C 669 nt0.15□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 SDH2YLL041C 801 nt0.15□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 ARV1YLR242C 966 nt0.15□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 SNO2YNL334C 669 nt0.15□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 snR34snR34 203 nt0.15□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 BFR2YDR299W 1605 nt0.15□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 WAR1YML076C 2835 nt0.15□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 MMS4YBR098W 2076 nt0.15□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 RUB1YDR139C 234 nt0.14□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 OST1YJL002C 1431 nt0.13□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 CHS6YJL099W 2241 nt0.13□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 HNT1YDL125C 477 nt0.13□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 RPS24BYIL069C 408 nt0.13□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.13□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 GPX1YKL026C 504 nt0.13□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 YOR218CYOR218C 420 nt0.13□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 SLI15YBR156C 2097 nt0.13□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 BEM3YPL115C 3387 nt0.13□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.12□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 YPL080CYPL080C 327 nt0.12□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 ATP20YPR020W 348 nt0.12□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 YPR153WYPR153W 423 nt0.12□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 TRS65YGR166W 1683 nt0.11□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 GEA2YEL022W 4380 nt0.11□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 YMR160WYMR160W 2451 nt0.11□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 YEL057CYEL057C 702 nt0.11□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.11□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 SBH1YER087C-B 249 nt0.11□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 CMS1YLR003C 876 nt0.11□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 SLY1YDR189W 2001 nt0.11□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 OST5YGL226C-A 261 nt0.1□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 HIT1YJR055W 495 nt0.1□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 LCD1YDR499W 2244 nt0.1□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 UTP20YBL004W 7482 nt0.1□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 MDM32YOR147W 1869 nt0.1□□□□□ -2.39
CNL1Q06333 YDL152WYDL152W 366 nt0.09□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 RPL26BYGR034W 384 nt0.09□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.09□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 DFG10YIL049W 762 nt0.09□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 PPN1YDR452W 2025 nt0.09□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 YCK3YER123W 1575 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 DAD1YDR016C 285 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 YDR114CYDR114C 303 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 MET32YDR253C 576 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 YGR042WYGR042W 816 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 RPL37AYLR185W 267 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 YOR282WYOR282W 321 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 NPR2YEL062W 1848 nt0.08□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.07□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 TYE7YOR344C 876 nt0.07□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 IRC2YDR112W 309 nt0.06□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 UPS1YLR193C 528 nt0.06□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 GUP1YGL084C 1683 nt0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.6 ms