Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 RRP6YOR001W 2202 nt2.15□□□□□ -2.06
PDR8Q06149 GUP1YGL084C 1683 nt2.15□□□□□ -2.06
PDR8Q06149 YLR149CYLR149C 2193 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 STB4YMR019W 2850 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 IRA2YOL081W 9240 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 COS111YBR203W 2775 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 YGL149WYGL149W 306 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 YHL041WYHL041W 450 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 YIL059CYIL059C 366 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 HTB2YBL002W 396 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 SAR1YPL218W 573 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 DFG16YOR030W 1860 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 RIC1YLR039C 3171 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 IRC8YJL051W 2469 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 CDC27YBL084C 2277 nt2.15□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 GIS1YDR096W 2685 nt2.14□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 ALK2YBL009W 2031 nt2.14□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 HTL1YCR020W-B 237 nt2.14□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 YDR048CYDR048C 315 nt2.14□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.14□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 snR51snR51 107 nt2.14□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 UBR1YGR184C 5853 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 RAV1YJR033C 4074 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 VTC1YER072W 390 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 PRE4YFR050C 801 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 RPS17AYML024W 411 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 CRM1YGR218W 3255 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 YBR184WYBR184W 1572 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 CLN3YAL040C 1743 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 SMC6YLR383W 3345 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 PEP3YLR148W 2757 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 SEF1YBL066C 3447 nt2.13□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.12□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 YOP1YPR028W 543 nt2.12□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 MGM1YOR211C 2646 nt2.12□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 NUP170YBL079W 4509 nt2.12□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 CDC53YDL132W 2448 nt2.11□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 TFC3YAL001C 3483 nt2.11□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 SEC16YPL085W 6588 nt2.11□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 SPP41YDR464W 4308 nt2.11□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 SAP190YKR028W 3102 nt2.11□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 PEX8YGR077C 1770 nt2.1□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 SMY1YKL079W 1971 nt2.1□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 VMR1YHL035C 4779 nt2.1□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.1□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 HHT1YBR010W 411 nt2.1□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 SCH9YHR205W 2475 nt2.1□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 RIM20YOR275C 1986 nt2.09□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 MCM22YJR135C 720 nt2.09□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 RPL38YLR325C 237 nt2.09□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.09□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 IST2YBR086C 2841 nt2.09□□□□□ -2.07
PDR8Q06149 DBP6YNR038W 1890 nt2.08□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YJL015CYJL015C 285 nt2.08□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YBL083CYBL083C 426 nt2.08□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YOR333CYOR333C 417 nt2.08□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 NUT2YPR168W 474 nt2.08□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 ELG1YOR144C 2376 nt2.08□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 SAP185YJL098W 3177 nt2.07□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YDR286CYDR286C 345 nt2.07□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YIL102CYIL102C 306 nt2.07□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 TUS1YLR425W 3924 nt2.07□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 SET2YJL168C 2202 nt2.07□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 HDA3YPR179C 1968 nt2.07□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 MNL2YLR057W 2550 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 VPS34YLR240W 2628 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 SNF5YBR289W 2718 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 UTP22YGR090W 3714 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 CYC7YEL039C 342 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YGR069WYGR069W 336 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 ATP7YKL016C 525 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 UPS1YLR193C 528 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 NOP53YPL146C 1368 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 MMS22YLR320W 4365 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 GIP3YPL137C 3831 nt2.06□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 IRR1YIL026C 3453 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 SSD1YDR293C 3753 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 UBP2YOR124C 3819 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 VPH1YOR270C 2523 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 NPC2YDL046W 522 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YDR344CYDR344C 444 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 RPL42BYHR141C 321 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YLR053CYLR053C 327 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 RPL42AYNL162W 321 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 PXA2YKL188C 2562 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 GRR1YJR090C 3456 nt2.05□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 USO1YDL058W 5373 nt2.04□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 HOP2YGL033W 657 nt2.04□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 ALG13YGL047W 609 nt2.04□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YIL032CYIL032C 357 nt2.04□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.04□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 EFR3YMR212C 2349 nt2.04□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YNL114CYNL114C 372 nt2.04□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 AGC1YPR021C 2709 nt2.03□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YDL062WYDL062W 426 nt2.03□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 PCC1YKR095W-A 267 nt2.03□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.03□□□□□ -2.08
PDR8Q06149 MET18YIL128W 3099 nt2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.7 ms